MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo clone fragment b

Total Repeats: 202

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_167351	TAA	2	6	339	344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NT_167351	A	6	6	343	348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_167351	CTTTG	2	10	383	392	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NT_167351	TCT	2	6	472	477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NT_167351	ATT	2	6	495	500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NT_167351	TA	3	6	522	527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_167351	T	9	9	529	537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NT_167351	T	7	7	603	609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_167351	T	6	6	611	616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NT_167351	A	7	7	617	623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NT_167351	GTA	2	6	659	664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NT_167351	TAA	2	6	673	678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NT_167351	ATT	2	6	736	741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NT_167351	TAT	2	6	748	753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NT_167351	TTA	2	6	762	767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NT_167351	TAT	2	6	819	824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_167351	T	7	7	824	830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NT_167351	A	6	6	831	836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NT_167351	T	6	6	885	890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_167351	TTTAT	2	10	898	907	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NT_167351	TA	3	6	923	928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_167351	TAA	2	6	953	958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_167351	ATT	2	6	1019	1024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_167351	CTT	2	6	1028	1033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NT_167351	ATT	2	6	1173	1178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NT_167351	AGA	2	6	1189	1194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NT_167351	AT	3	6	1215	1220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NT_167351	TTC	2	6	1267	1272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NT_167351	TAA	2	6	1319	1324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NT_167351	ATTTTT	3	18	1354	1371	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NT_167351	TAT	2	6	1407	1412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NT_167351	AGG	2	6	1443	1448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NT_167351	TTAAA	2	10	3114	3123	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NT_167351	TAA	2	6	3132	3137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NT_167351	ATT	2	6	3151	3156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NT_167351	T	7	7	3155	3161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NT_167351	TTTTA	2	10	3168	3177	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NT_167351	TAT	2	6	3230	3235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NT_167351	T	6	6	3235	3240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NT_167351	A	6	6	3252	3257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NT_167351	TTG	2	6	3263	3268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NT_167351	T	6	6	3295	3300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NT_167351	TAA	2	6	3439	3444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NT_167351	TTG	2	6	3470	3475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NT_167351	CCACA	2	10	3484	3493	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
46	NT_167351	A	6	6	3511	3516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NT_167351	A	6	6	3541	3546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NT_167351	AGA	2	6	3548	3553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NT_167351	A	6	6	3572	3577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NT_167351	AAG	2	6	3585	3590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NT_167351	AAT	2	6	3599	3604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NT_167351	CTT	2	6	3605	3610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NT_167351	A	6	6	3624	3629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NT_167351	AAATA	2	10	3649	3658	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NT_167351	TAAT	2	8	3667	3674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NT_167351	A	7	7	3697	3703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NT_167351	G	8	8	3718	3725	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
58	NT_167351	TAA	2	6	3837	3842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NT_167351	AAG	2	6	3879	3884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NT_167351	AAAATA	2	12	3905	3916	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NT_167351	A	8	8	3952	3959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NT_167351	AAAG	2	8	3980	3987	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NT_167351	TAA	2	6	4037	4042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NT_167351	TAAT	2	8	4057	4064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NT_167351	A	7	7	4068	4074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NT_167351	AG	3	6	4093	4098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NT_167351	A	6	6	4112	4117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NT_167351	TAT	2	6	4153	4158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NT_167351	TATT	2	8	4193	4200	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NT_167351	TAA	2	6	4229	4234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NT_167351	ATC	2	6	4859	4864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NT_167351	TA	3	6	4871	4876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NT_167351	ATT	2	6	4890	4895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NT_167351	AGAT	2	8	4923	4930	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NT_167351	AAT	2	6	5026	5031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NT_167351	AAAT	2	8	5041	5048	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NT_167351	ACAT	2	8	5066	5073	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NT_167351	ATA	3	9	5083	5091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NT_167351	TAA	2	6	5099	5104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NT_167351	TAAA	3	12	5114	5125	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NT_167351	ATCA	2	8	5136	5143	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NT_167351	AT	3	6	5147	5152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NT_167351	ATT	3	9	5207	5215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NT_167351	TA	3	6	5223	5228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NT_167351	TAATAT	2	12	5236	5247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NT_167351	ATTAA	2	10	5267	5276	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NT_167351	TGTT	2	8	5331	5338	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NT_167351	A	7	7	5425	5431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NT_167351	AAG	2	6	5465	5470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NT_167351	A	6	6	5490	5495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NT_167351	TGA	2	6	5505	5510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NT_167351	A	6	6	5559	5564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NT_167351	AGA	2	6	5567	5572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NT_167351	ATA	2	6	5650	5655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NT_167351	TGATAT	2	12	5704	5715	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NT_167351	CAG	2	6	5763	5768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NT_167351	TAT	2	6	5800	5805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NT_167351	TTAA	2	8	6133	6140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NT_167351	TAAA	3	12	6211	6222	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NT_167351	TTTAA	2	10	6240	6249	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NT_167351	ATT	2	6	6275	6280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NT_167351	ATT	4	12	6355	6366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NT_167351	TATAT	2	10	6372	6381	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NT_167351	TA	4	8	6386	6393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NT_167351	T	7	7	6410	6416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NT_167351	TAA	2	6	6470	6475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NT_167351	T	6	6	6602	6607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NT_167351	ATT	2	6	6622	6627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NT_167351	AATA	2	8	6630	6637	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NT_167351	ATA	2	6	6647	6652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NT_167351	CATA	2	8	6726	6733	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NT_167351	ATTA	2	8	6770	6777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NT_167351	AAT	2	6	6844	6849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NT_167351	AAT	2	6	6878	6883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NT_167351	A	7	7	6913	6919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NT_167351	CTA	2	6	6974	6979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NT_167351	A	9	9	7008	7016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NT_167351	AT	4	8	7318	7325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NT_167351	ATT	2	6	7350	7355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NT_167351	ATT	2	6	7659	7664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NT_167351	AGC	2	6	7667	7672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NT_167351	CAA	2	6	7946	7951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NT_167351	T	6	6	7977	7982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NT_167351	TAA	2	6	8010	8015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NT_167351	CTT	2	6	8031	8036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NT_167351	A	6	6	8069	8074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NT_167351	GAA	2	6	8518	8523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NT_167351	A	6	6	8530	8535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NT_167351	GAA	2	6	8580	8585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NT_167351	A	6	6	8590	8595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NT_167351	ACAAA	2	10	8620	8629	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NT_167351	A	6	6	8671	8676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NT_167351	CGAA	2	8	8717	8724	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NT_167351	TAG	2	6	8780	8785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NT_167351	ATT	2	6	9027	9032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NT_167351	AGA	2	6	9035	9040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NT_167351	A	6	6	9055	9060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NT_167351	AAT	2	6	9081	9086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NT_167351	TTAG	2	8	9129	9136	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NT_167351	A	7	7	9149	9155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NT_167351	AATT	2	8	9205	9212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NT_167351	TA	3	6	9231	9236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NT_167351	A	7	7	9818	9824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NT_167351	T	7	7	9840	9846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NT_167351	AT	3	6	12285	12290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NT_167351	T	7	7	12309	12315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NT_167351	TACAAA	2	12	12384	12395	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
148	NT_167351	ATTTTA	2	12	12399	12410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NT_167351	A	6	6	12445	12450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NT_167351	TTTA	2	8	12475	12482	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NT_167351	CT	3	6	12504	12509	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NT_167351	TAA	3	9	12511	12519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NT_167351	GT	3	6	12543	12548	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NT_167351	AGT	2	6	12599	12604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NT_167351	ATT	2	6	12623	12628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NT_167351	A	6	6	12922	12927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NT_167351	T	8	8	12932	12939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NT_167351	GAA	2	6	12979	12984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NT_167351	A	8	8	12983	12990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NT_167351	T	6	6	12996	13001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NT_167351	A	6	6	13014	13019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NT_167351	AGA	2	6	13031	13036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NT_167351	TAA	2	6	13201	13206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NT_167351	AGT	2	6	13323	13328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
165	NT_167351	TTA	2	6	13383	13388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NT_167351	TTAT	2	8	13431	13438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NT_167351	TAT	3	9	13436	13444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NT_167351	CTT	2	6	13469	13474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
169	NT_167351	GAA	2	6	13498	13503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
170	NT_167351	TATAA	2	10	13554	13563	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NT_167351	TCT	2	6	14274	14279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
172	NT_167351	T	6	6	14281	14286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NT_167351	A	9	9	14295	14303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NT_167351	CTAT	2	8	14307	14314	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
175	NT_167351	AGC	2	6	14398	14403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
176	NT_167351	TGA	2	6	14404	14409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
177	NT_167351	ATC	2	6	14422	14427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
178	NT_167351	TTC	2	6	14428	14433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
179	NT_167351	TAA	2	6	14566	14571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NT_167351	TA	3	6	14576	14581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NT_167351	TA	3	6	14584	14589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NT_167351	TAAA	2	8	14598	14605	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NT_167351	T	6	6	14612	14617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NT_167351	ATAA	2	8	14621	14628	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NT_167351	ATT	2	6	14629	14634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NT_167351	TAA	2	6	14638	14643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NT_167351	TAA	2	6	14686	14691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NT_167351	ATA	2	6	14700	14705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NT_167351	AT	3	6	14733	14738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NT_167351	A	8	8	14752	14759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NT_167351	A	6	6	14817	14822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NT_167351	TAT	2	6	14826	14831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NT_167351	A	6	6	14833	14838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NT_167351	AAGT	2	8	14863	14870	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
195	NT_167351	TAA	2	6	14950	14955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NT_167351	T	6	6	14956	14961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NT_167351	TAA	2	6	15039	15044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NT_167351	A	6	6	15047	15052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NT_167351	TA	3	6	15075	15080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
200	NT_167351	ATA	2	6	15106	15111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
201	NT_167351	ATATT	2	10	15113	15122	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
202	NT_167351	AAAGA	2	10	15387	15396	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.